Фамилия Видукин — один из тех случаев, когда корень ясен, а вот значение ускользает. В её основе лежит имя или прозвище Видука. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Видукин, то есть сын или потомок Видуки.

Сам корень «вид» многозначен. Самое прямое объяснение — от глагола «видеть». Прозвище Видука могли дать зоркому, наблюдательному человеку, тому, кто всё замечал. Однако в русских говорах слово «видун» (или «видуха») имело и более узкий, магический смысл — так называли знахаря, колдуна, человека, обладающего «видением», способного предсказывать или видеть то, что скрыто от других. В этом случае фамилия могла закрепиться за потомками деревенского ведуна.

Есть и менее очевидная версия. В некоторых диалектах «видука» — вариант имени Виктор или Виталий в простонародном, сокращённом произношении. Такие уменьшительные формы (Миха — Михин, Петя — Петин) были обычным делом при образовании фамилий. Если это так, то Видукин — всего лишь «Викторов» или «Витальев», но в местном звучании.

Фамилия редкая и, скорее всего, имеет северное или вятское происхождение: именно там фиксируются старые прозвища с корнем «вид» в значении «колдовство». В центральных и южных областях она почти не встречается.

Словообразовательная модель простая, но сам корень делает фамилию небанальной. В отличие от множества «Ивановых» или «Петровых», Видукин сразу задаёт вопрос: а кем был тот самый Видука? Ответ, скорее всего, лежит в области народных верований или местного говора, что и придаёт фамилии особый колорит.