Фамилия Видякин происходит от личного имени или прозвища Видяка. Самая неочевидная из версий — мордовская: слово «видемс» означает «сеять», так что имя Видяка могли понимать как «засеянный», «тот, кого посеяли». Скорее всего, это не прямое значение, а родительское имя-оберег, данное ребёнку, чтобы он прижился в роду, как посеянное зерно.

Вторая версия лежит на поверхности: в русских говорах «видякой» называли человека опытного, много повидавшего. Прозвище Видяка могли дать бывалому страннику, старому работнику или просто человеку с богатой биографией. Такие прозвища легко переходили в фамилии, особенно если человек был заметен в общине.

Третья гипотеза связывает Видяку с каноническим именем Бенедикт (от лат. «benedictus» — благословенный). В просторечии Бенедикт мог превратиться в Видяку через цепочку народных переделок: Беня, Веня, Видя. Это не единичный случай: так же появились фамилии Веденеев, Ведяев и другие, восходящие к тому же корню.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — «сын Видяки». Спор между версиями решается в пользу русской или мордовской основы в зависимости от региона бытования фамилии. Если предки жили в Поволжье, особенно на территории Мордовии, то версия с «сеятелем» становится весомее. В центральных и северных областях России надёжнее считать основой прозвище или сокращение от Бенедикта.

Точных исторических записей о первых носителях фамилии Видякин в открытых источниках мало, что типично для фамилий, не принадлежавших знатным родам. Скорее всего, это фамилия крестьянская или мещанская, оформившаяся к XVII–XVIII векам.