Фамилия Виннер почти наверняка имеет немецкие корни. В её основе лежит слово Wiener — так по-немецки называют жителя Вены. Первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище по месту, откуда он пришёл или где жил. В русском языке это прозвище закрепилось в форме «Виннер», без лишних суффиксов, что указывает на сравнительно позднее появление фамилии и её нерусское происхождение.

Вена, давшая название этой фамилии, — древний город. Она выросла на месте римского военного лагеря Виндобона, основанного ещё в I веке. К XII веку Вена стала резиденцией австрийских герцогов и крупным европейским центром. Для человека, переселившегося из Вены в другую страну, прозвище «Виннер» было естественным способом указать на его происхождение — так же, как в России называли выходцев из других городов.

Интересно, что фамилия Виннер могла появиться и в результате миграции немецкоязычных колонистов, в том числе в Российскую империю в XVIII–XIX веках. В таком случае предок носителя фамилии мог быть ремесленником, торговцем или специалистом, приглашённым на службу. В отличие от многих русских фамилий, образованных с помощью суффиксов -ов или -ин, фамилия Виннер сохранила свою исходную немецкую форму без русификации.

Что касается самого города, то Вена известна своей архитектурой. Среди её символов — Августинская церковь XIV века в дворцовом комплексе Хофбург, где молился императорский двор; дворец Бельведер с двумя особняками в стиле рококо, построенными в начале XVIII века; и Дом Музыки — высокотехнологичный музей, занимающий несколько этажей дворца начала XIX века. Но для истории фамилии Виннер важнее другое: она прямо указывает на связь человека с этим городом, а не с каким-то конкретным зданием или достопримечательностью.