Фамилия Водуков, вероятно, происходит от прозвища Водук. По одной из версий, в его основе лежит нарицательное «вод». Даля это слово толкуется как «поводырь, военачальник, коновод, погонщик лошадей». Поэтому вполне возможно, что прозвище Водук относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Согласно еще одной гипотезе, фамилия образована от нецерковного имени Водук, которое восходит к существительному «вода». Так и прозвище Водук закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Водуков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Водук, со временем получил фамилию Водуков.