Фамилия Волкуногова — женская форма фамилии Волкуного́в, и её происхождение уходит корнями в прозвище, которое могло звучать как Волкуно́г. По модели образования это типичная русская фамилия на -ов, но с редкой и яркой основой. Вместо обычного «Волков» или «Волконогов» здесь вторая часть явно связана с ногой, что сразу наводит на мысль о человеке с необычной походкой, хромотой или, наоборот, быстротой и силой ног.

Самая правдоподобная версия — прозвище Волкуног дали человеку с волчьей хваткой в движении: либо быстро бегающему, либо тому, кто, подобно волку, мог преодолевать большие расстояния. В русских говорах слово «волк» часто использовалось в переносном смысле для обозначения хитрого, одинокого или выносливого человека. Вторая часть — «нога» — могла указывать на физическую особенность: например, кривые ноги (как у волка) или сильные, жилистые ноги, характерные для охотников и следопытов.

Есть и более прозаичное объяснение: в некоторых диалектах «волкуногом» могли называть человека, который при ходьбе волочил ногу — от глагола «волочь» (тащить). Но здесь скорее игра слов: народная этимология могла переосмыслить «волочь» в сторону «волк», сделав прозвище более запоминающимся и звериным. Сравните с фамилиями Волкобой, Волкогон — все они из одного ряда прозвищ, где зверь обозначал не родство, а качество.

Географически фамилия редкая, но встречается в центральных и южных областях России, особенно в казачьих регионах, где прозвища с животными были в ходу. Суффикс -ов указывает на то, что предок носителя был либо крестьянином, либо служилым человеком — у дворянских родов чаще встречались фамилии на -ский. Сословно Волкуноговы, скорее всего, крестьянского или однодворческого происхождения, и фамилия закрепилась за потомками человека с характерным прозвищем, которое со временем потеряло связь с реальным значением и стало просто родовым именем.