Фамилия Володиковы образована от имени Володик — народной, обиходной формы крестильного имени Владимир. В народном сознании имя Владимир переосмыслили как «владеющий миром» (от слов «миръ» — спокойствие и «міръ» — вселенная), хотя с точки зрения исторической лингвистики оно происходит от древнерусского «Володимѣръ» (владеющий по-своему, славный властью). Уменьшительный суффикс -ик придавал имени ласковый, домашний оттенок, а фамильный суффикс -ов указывает на принадлежность: Володиков — буквально «сын Володика».

Эта фамилия — яркий пример того, как церковное имя, попав в бытовую речь, обрастало просторечными вариантами. В отличие от фамилий на -ин (Володикин), форма с -ов типична для северных и центральных областей России. Поскольку имя Владимир было распространено повсеместно, фамилия Володиковы встречается в разных регионах, но чаще всего её корни ведут в крестьянскую или мещанскую среду XVI–XVII веков, когда фамилии только закреплялись за родами. В писцовых книгах того времени можно встретить крестьян Володиковых в новгородских и тверских землях.

Редкое окончание во множественном числе (Володиковы, а не Володиков) указывает на то, что фамилия могла бытовать в форме родового прозвания — так называли всю семью, а не одного человека. Это делает её интересным памятником не только письменности, но и живого народного словообразования.