Фамилия Володкина принадлежит к числу так называемых «полуотчеств» — образована не напрямую от полного имени, а от его уменьшительной или обиходной формы. Основа здесь — Володка, просторечный вариант имени Владимир. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Володкина буквально означает «дочь или жена Володки». В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я, что и произошло в данном случае.

Интересно, что имя Владимир в народной среде давало целый веер производных: Володя, Володька, Володка, Владя, Вова. Форма Володка считалась сниженной, бытовой — так могли называть не только в семье, но и в крестьянской или ремесленной среде, где полное церковное имя употребляли реже. Соответственно, фамилия Володкин (и женская Володкина) закрепилась за потомками человека, которого в обиходе звали Володкой, а не Владимиром.

По модели образования фамилия типична для северных и центральных областей России, а также для Поволжья. В южнорусских и украинских говорах предпочтение отдавали суффиксу -енко, поэтому там чаще встречается Володченко. Географически Володкины рассеяны по всей стране, но заметное скопление фиксируется в Вологодской, Кировской и Нижегородской областях — то есть в регионах, где в XVI–XVII веках активно шёл процесс закрепления прозвищ и отчеств в качестве фамилий.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Володкина в большинстве своём происходили из крестьян и посадских людей. В дворянских родословных эта фамилия не встречается, что косвенно подтверждает её «низовое» происхождение: фамилии на -ин от уменьшительных имён редко получали представители высших сословий, предпочитавших полные формы (Владимиров, Владимирский).

В современном написании фамилия сохраняет букву «о» в корне, хотя в разговорной речи нередко слышится «Владкина» — под влиянием имени Влад. Однако этимологически верным остаётся вариант через «о», поскольку он восходит к Владимиру, а не к Владу. Это один из тех случаев, когда написание фамилии оказывается консервативнее произношения.