Фамилия Воронькова образована от прозвища или мирского имени Воронько. В основе — слово «ворон». Суффикс -к- уменьшительно-ласкательный, а -о — типичное окончание для прозвищ в южнорусских и украинских говорах. Воронько — это не просто «маленький ворон», а скорее ласковое или ироничное прозвище черноволосого, смуглого или даже угрюмого человека. Ворон в народной культуре — птица вещая, мудрая, но и недобрая, поэтому прозвище могло закрепиться за тем, кого считали колдуном, знахарем или просто нелюдимым.

Сама фамилия Воронькова — женская форма от Вороньков. Мужской вариант Вороньков указывает на принадлежность: «чей?» — Вороньков, то есть сын или потомок Воронько. Такая модель (прозвище на -о + суффикс -ов) характерна для восточнославянских фамилий, особенно распространённых на юге России, в Белгородской, Воронежской, Курской областях, а также на Украине. Там уменьшительные формы имён и прозвищ на -ко особенно часты.

Интересная деталь: в русских говорах «воронько» могло означать не только птицу, но и коня вороной масти. Так что предок мог быть владельцем или просто ездоком на вороном коне. Встречается и диалектное «воронька» — так в некоторых местах называли черную корову. В любом случае, основа фамилии связана с цветом — чёрным, вороным. Это ставит её в один ряд с фамилиями Чернов, Чернышов, Воронов, но с более личным, прозвищным оттенком.

В документах фамилия встречается с XVII века. Например, в переписных книгах Курского края упоминаются крестьяне Вороньковы. В дворянских родословных книгах эта фамилия не зафиксирована — носители её, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Вороньковых много и сегодня, особенно в Центральной России и Поволжье.