Основой фамилии Войкин послужило мирское имя Войка. Фамилия Войкин, предположительно, образована от имени Войка. Оно представляет собой производную форму очень распространенного на Руси имени Воин. Иногда малограмотные священники по ошибке нарекали младенца не именем святого, а его прозванием. Так и появились люди с официальным именем Воин. Возможно также, что фамилия Войкин происходит от прозвища Войка. Оно может брать начало от глагола «выть». Вероятно, именование Войка отражает особенности характера его обладателя. Так могли назвать плаксивого, капризного ребенка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Войка, со временем получил фамилию Войкин. Так, например, в Книге памяти Московской области упоминаются Борис Николаевич Войкин, родившийся в 1920 году в Серпухове Московской области, Ефим Матвеевич Войкин, родившийся в 1883 оду в деревне Пущено Серпуховского района. В Книге памяти Республики Башкортостан содержится информация о Василии Филипповиче Войкине, родившемся в деревне Гумбетово Стерлибашевского района Башкирии.