Фамилия Войта ведет начало от прозвища, связанного с должностью. В основе — нарицательное «войт». Войтом в старину называли человека, в чьи обязанности входило устанавливать очередность работ по благоустройству, собирать поборы с городских лавок, расходовать собранные суммы и решать другие городские дела. Так что предок носителя этой фамилии, скорее всего, был административным лицом — не просто ремесленником или крестьянином, а человеком, облеченным хозяйственной властью в городе или посаде.

Модель образования фамилии проста: прозвище Войта перешло в фамилию без дополнительных суффиксов. Это характерно для украинских, белорусских и южнорусских фамилий, где окончание -а нередко закрепляется за мужской фамилией в именительном падеже. В русской традиции чаще встречаются формы Войтов или Войтев, а вариант Войта указывает на западнорусские или украинские корни.

Существует и другая версия происхождения: от слова «войтюк» — «воин». В этом случае прозвище тоже указывало бы на род занятий, но военного, а не гражданского. Однако эта гипотеза менее убедительна: «войтюк» — слово редкое, диалектное, тогда как должность войта хорошо задокументирована в истории городов с магдебургским правом, особенно на территории современной Украины, Беларуси и Польши. Поэтому связь с административной должностью выглядит правдоподобнее.

Фамилия Войта встречается нечасто, и её географическая привязка — преимущественно западные области бывшей Российской империи. В отличие от фамилий на -ов или -ин, она не прошла полную русификацию, что помогает точнее определить регион, откуда пошел род.