Фамилия Войтовский — одна из тех, что сразу выдают географический и социальный корень. Её основа — слово «войт». В польской, литовской, украинской и белорусской традиции так называли выборное лицо: сельского старосту, городского голову или судью. В Речи Посполитой войт был заметной фигурой — он представлял общину перед магнатами, вершил мелкий суд, собирал подати. Прозвище Войт закрепилось за человеком, который занимал эту должность или был сыном войта. Суффикс -овск- (с ударением на втором слоге) типичен для фамилий польского и западнорусского происхождения: он образовывал притяжательные прилагательные, которые затем становились фамилиями шляхты и мещан. Войтовский буквально означает «принадлежащий Войту» или «из рода Войта».

Споров у этой фамилии почти нет. Версия о происхождении от немецкого Wacht (стража) или от славянского «войт» в значении «воевода» — слабая и натянутая. Основной корень ясен, и он указывает на административную роль предка. В Российской империи фамилия Войтовский чаще всего встречалась в западных губерниях — Волынской, Гродненской, Минской, а также среди польской шляхты, которая после разделов Речи Посполитой сохраняла свои фамилии. Войтовские могли быть как крестьянами, получившими фамилию от прозвища деда-войта, так и мелкопоместными дворянами, чьи предки действительно занимали эту должность и записали её в гербовник.

Любопытная деталь: в польском языке фамилия звучит как Wojtowski, с мягким «й». В русской передаче твёрдое «т» и окончание -ский закрепились под влиянием канцелярского произношения XIX века. Это же различие видно в однокоренных фамилиях: Войтов, Войтенко, Войтишек — все они от одного корня, но разошлись по суффиксам в зависимости от региона. Войтовский — один из самых «польских» вариантов, и если предки носителя жили на территории бывшей Речи Посполитой, то, скорее всего, они имели прямое отношение к местному самоуправлению, а не к военному делу.