Фамилия Выдрина — одна из тех русских фамилий, которые произошли напрямую от прозвища. В основе лежит слово «выдра» — так на Руси могли назвать человека за конкретные черты характера или внешности. Скорее всего, прозвище прилипало к тому, кто был ловок, изворотлив или умел «выходить сухим из воды» — как этот зверёк. Впрочем, не исключён и намёк на внешность, скажем, на тёмные волосы или усы.

Документы подтверждают, что прозвище было в ходу уже в XVI–XVII веках. В «Ономастиконе» Степана Веселовского упомянут Иван Выдра, крестьянин новгородских земель (1545 год), и Денис Выдрин, посадский человек из Тотьмы (1625 год). Обратите внимание: Денис записан уже с суффиксом -ин, то есть фамилия могла закрепиться за его потомками ещё до того, как стала повсеместной.

Суффикс -ин в фамилии Выдрина указывает на принадлежность: «чей?» — «Выдрин», то есть сын или человек из рода Выдры. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Если бы прозвище звучало как Выдр, фамилия была бы Выдров, но в истории закрепился именно «женский» вариант основы.

Географически фамилия исторически привязана к северным и центральным регионам России. Тотьма (ныне Вологодская область) и Новгород — это зона активного бытования «звериных» прозвищ, где они не несли оскорбительного смысла, а служили практичными внутрисемейными метками.