Фамилия Вышкваркин образована от прозвища Вышкварка, которое восходит к украинскому глаголу «вишкварювати», что означает «вытапливать жир из сала». Вероятно, прозвище Вышкварка относилось к числу так называемых «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности предка. Можно предположить, что основатель рода Вышкваркиных был поваром. Чередование гласных и/ы, в данном случае, объясняется тем, что русская буква «ы» в украинском языке пишется как «и». Так и прозвище Вышкварка закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Вышкваркин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Вышкварка, со временем получил фамилию Вышкваркин.