Фамилия Вышкваркова — женская форма фамилии Вышкварков, которая образована от прозвища или мирского имени Вышквар. В основе, скорее всего, лежит глагол «вышкварить». В русских говорах (особенно южных и украинских) это слово означало «выпарить», «обдать кипятком», «ошпарить». Прозвище Вышквар могли дать человеку с крутым, «ошпаривающим» нравом, либо тому, кто занимался вываркой чего-либо — например, соли, дегтя или мыла. В украинском языке «вишкварка» — это также вытопка, шкварка, что связывает фамилию с кулинарным или хозяйственным делом.

Суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ на твердый согласный. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. Окончание -а в женской форме — стандартное грамматическое изменение по роду.

Географически фамилия Вышкварков встречается преимущественно на юге России и востоке Украины — в Курской, Белгородской, Ростовской областях, а также в Краснодарском крае. Это подтверждает диалектное происхождение основы: слово «вышкварить» характерно именно для южнорусских и малороссийских говоров.

Встречается также вариант написания с буквой «ы» в корне — Вышкварков, что не меняет смысла. Родственные фамилии — Шкварков, Шкваров, Вышкваров — образованы от того же корня «шквар-» (шкварчать, шкварка). Таким образом, предок носительницы фамилии Вышкваркова, вероятно, был либо человеком с горячим, резким характером, либо мастером, связанным с вываркой или жаркой.