Фамилия Яшинева — женская форма, в мужском варианте — Яшинев. Это относительно редкая фамилия, и её происхождение стоит искать не в очевидном имени Яша (уменьшительном от Яков), а в более сложной словообразовательной модели.

В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Яшиня. Суффикс -ин- в фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Яшинин, то есть сын Яшини. Однако в данном случае мы видим форму Яшинев, а не Яшинин. Это ключевой момент. Фамилия могла образоваться от прозвища Яшень (с суффиксом -ень, который в русских говорах давал формы притяжательных прилагательных типа «Яшнев»), но затем под влиянием более продуктивной модели на -ев (как в фамилиях от имён на -а: Кузьма — Кузьмин, но Фома — Фомин, а не Фомев) форма закрепилась как Яшинев. Либо, что более вероятно, основа — Яшина (женское прозвище или имя), и тогда фамилия Яшинев — это вариант притяжательного прилагательного от женского имени, что встречается реже, но возможно в северных и центральных говорах, где женские прозвища на -а давали фамилии на -ев (сравните: Глафира — Глафирев).

Само прозвище Яшиня или Яшень — это ласкательная форма от имени Яков (через народное Яша). В ономастике такие формы фиксируются в писцовых книгах XVI–XVII веков: например, крестьянин Яшиня упоминается в новгородских землях. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был сыном или потомком человека по прозвищу Яшиня — возможно, невысокого роста, юркого или просто любимого в семье.

Географически фамилия Яшинев тяготеет к центральным областям России (Тверская, Ярославская, Владимирская губернии), где суффикс -ев в фамилиях от имён на -а был более распространён, чем на севере. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении — от прозвища, бытовавшего в одной-двух деревнях. В отличие от массовой фамилии Яшин, Яшинев сохранила более архаичную словообразовательную ступень.

Итог: ваши предки по мужской линии носили прозвище Яшиня (ласкательное от Яков), и фамилия закрепилась в форме, характерной для определённого диалектного ареала. Это не «ошибка» в написании, а живое свидетельство того, как в XVII–XVIII веках местные говоры влияли на оформление фамилий.