Фамилия Йонко — редкий пример того, как одна буква меняет всю историю поиска корней. Если бы она писалась через «ё» (Ёнко), то сразу читалась бы как типичная украинская или белорусская фамилия на -ко. Но «Й» — это указание на западный славянский или балтийский след.

Скорее всего, перед нами польская или западноукраинская фамилия, образованная от имени Йон (Joan, Jan) — местной формы Иван. В польском языке начальное «Йо» часто появляется при адаптации христианских имён: Йозеф, Йоахим. Соответственно, Йонко — это уменьшительно-ласкательное от Йон (как Ванька от Иван). Суффикс -ко в польском языке не столь продуктивен, как в украинском, но встречается в восточных регионах бывшей Речи Посполитой. Поэтому носитель фамилии мог происходить из Подляшья, Галиции или Волыни.

Менее вероятная, но допустимая версия — литовские корни. В литовском языке есть мужское имя Jonas (аналог Иван), а суффикс -ko мог появиться под славянским влиянием. Фамилии с начальным «Й» в Литве встречаются, но обычно они пишутся через «J»: Jonko. Если предки жили на границе Литвы и Польши, фамилия могла оформиться именно в таком гибридном виде.

В любом случае, фамилия Йонко недвусмысленно отсылает к имени Иван в его западной огласовке. Она указывает на предка, которого в быту звали Йонком — уменьшительно, но без пренебрежения. Сословно фамилия не маркирована: её могли носить и крестьяне, и мещане, но в дворянских гербовниках она не встречается. Географически фамилия сегодня редка и встречается в основном в Польше, Беларуси и среди потомков эмигрантов.