Фамилия Зачарова — редкий случай, когда женская форма не просто грамматическое производное от мужской, а, возможно, исходная точка всей фамилии. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образуются от мужских прозвищ или имён: Зачар → Зачаров. Но здесь мы видим основу «зачар-», которая не имеет очевидного мужского аналога в крестильных именах (Захарий дал бы Захаров, а не Зачаров). Это наводит на мысль, что корень лежит не в календарном имени, а в прозвище или диалектном слове.

Самая прямая версия — связь с глаголом «зачаровывать», то есть колдовать, наводить чары. В северных и сибирских говорах «зачара» могли назвать знахарку, ворожею или женщину, которую подозревали в колдовстве. Фамилия могла закрепиться за потомками такой женщины — не за ней самой, а за её детьми, которых в деревне прозвали «Зачаровы» (то есть «те, чья мать — зачара»). Модель образования здесь та же, что в фамилиях Веселова, Ворожеева или Шептунова: женское прозвище или ремесло становится основой, а дети получают фамилию по матери.

Менее вероятная, но возможная версия — искажение от «Захаров» через аканье. В южнорусских говорах безударное «о» после шипящих могло перейти в «а»: Захаров произносили как [Захараф], а при записи на слух могли зафиксировать «Зачаров». Однако в этом случае логичнее было бы ожидать форму «Захаров» или «Захарин», а не с заменой корня. Кроме того, в фамилии Зачарова ударение обычно падает на второй слог (Зача́рова), что нехарактерно для производных от Захара (Заха́ров).

Географически фамилия встречается точечно, чаще на Русском Севере и в Поволжье — регионах, где долго сохранялись языческие пережитки и вера в колдовство. В этих местах прозвища, связанные с магией, не были редкостью и давались без уничижительного оттенка, скорее как констатация особого дара.

Таким образом, Зачарова — это, скорее всего, «дочь (или жена) знахарки». Фамилия не дворянская и не купеческая: она из крестьянской среды, где прозвища цеплялись к семье через мать, если её занятия или репутация выделяли её в общине. Искать в ней мистику не стоит — это бытовая, земная история про то, как в деревне называли людей с необычными способностями.