Фамилия Загардан — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами не типичная крестьянская или дворянская фамилия центральной России, а скорее позднее, искусственное или заимствованное образование.

Самый вероятный путь возникновения — географический. Фамилия могла быть образована от названия населённого пункта Загардан или Загарданье. Такие топонимы встречаются в зонах исторического смешения славянских, балтских и финно-угорских языков — например, на северо-западе России или в Беларуси. Корень «гард» восходит к древнескандинавскому garðr (ограда, двор, укрепление) или к германскому garden (сад). В славянской среде этот корень дал множество названий: Город, Городец, Гардин, а также — через литовское посредничество — Загардан. Приставка «за-» указывает на положение за этим «гардом»: за оградой, за крепостью, за садом. Человек, живший за таким объектом, получал прозвище Загардан, которое затем закрепилось как фамилия.

Вторая версия — прозвищная, но менее надёжная. В польском и украинском диалектах слово «гардан» могло означать гордеца, зазнайку или, наоборот, неряху (сравните с польским gardzić — презирать, брезговать). Тогда Загардан — это «загардившийся», то есть загордившийся человек. Однако эта этимология слаба: приставка «за-» в такой модели встречается редко, и фамилия с нею скорее указывала бы на место, а не на качество.

Фамилия явно не массовая. Её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких близких родов, расселившихся в XIX–XX веках. В дореволюционных источниках Загарданы могли записываться как мещане или однодворцы — потомки служилых людей, живших на западных рубежах. Сравните с однокоренными фамилиями: Гарданов, Гардин, Гардюк. У них общая основа, но суффиксы выдают разную социальную и географическую среду. Загардан стоит особняком — без суффикса, с явным топонимическим следом.

Что касается ударения, оно, скорее всего, падает на последний слог: Загарда́н. Это характерно для фамилий, пришедших из польского или литовского ареала. Фамилия не имеет отношения к русскому слову «гарда» (часть шпаги) — это случайное звуковое совпадение.