Фамилия Загинаева — довольно редкая, и её разговорный, почти «глагольный» корень сразу выдаёт человека, получившего прозвище за манеру поведения или речи. В основе фамилии лежит старый русский глагол «загинать» — то есть «загибать». В прямом смысле так могли назвать того, кто гнул что-то (например, кузнеца или бондаря), но гораздо чаще слово использовалось в переносном значении: «загинать» означало «говорить лишнее, хвастать, врать» или «говорить с заковыкой, с хитрецой». Прозвище Загинай получал болтун, хвастун или, наоборот, человек с острым языком, который умел «загнуть словцо».

Фамилия образована по типичной русской модели: от прозвища на -ай (Загинай) с помощью притяжательного суффикса -ев, который присоединялся к основам на мягкий согласный. Окончание -а указывает на женскую форму фамилии, которая закрепилась в документах, когда речь шла о женщине или о семье в целом. Мужской вариант — Загинаев.

В ономастике есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «загин» (изгиб, поворот реки). В этом случае прозвище могло относиться к человеку, жившему у крутого речного поворота. Однако модель образования от глагола (Загинай → Загинаев) встречается в русских фамилиях гораздо чаще, чем топонимическая, и подтверждается аналогиями: Болтаев, Ломаев, Кидаев.

Фамилия не принадлежала к дворянским родам и не фиксируется в старых боярских списках. Скорее всего, её носили крестьяне или посадские люди из центральных и южнорусских губерний, где диалектная форма «загинать» была особенно употребительна. Встречаемость фамилии крайне низкая, что делает её надёжным маркером для генеалогического поиска: скорее всего, все носители Загинаевых происходят из одной локальной группы или даже одного села.