Фамилия Закулина — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а, скорее всего, местная географическая особенность или прозвище, данное человеку по месту жительства. В отличие от массовых фамилий на -ов и -ев, суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Закулин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Закула.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «закул». В северных и сибирских говорах «закулом» называли глухой, отдалённый угол, захолустье или место за каким-либо укрытием (например, за кулисой, за кустом, за углом). Человек, живший «в закуле», то есть на отшибе, в глуши, получал прозвище Закула. Со временем это прозвище закрепилось за его потомками как фамилия.

Менее распространённая, но допустимая версия — связь с глаголом «закулать» (или «закуливать»), который в некоторых говорах означал «завернуть», «закутать», «спрятать». В этом случае прозвище могло относиться к человеку скрытному, нелюдимому или, наоборот, к тому, кто занимался упаковкой товаров, кулей. Однако географическая привязка выглядит убедительнее: фамилия Закулина встречается в основном в регионах, где слово «закул» было в ходу — в Архангельской, Вологодской областях, на Урале.

С точки зрения словообразования, фамилия проста и прозрачна: корень «закул-» плюс фамильный суффикс -ин. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Заку́лина. Родственные фамилии — Закулов, Закулинский, но они встречаются реже. В отличие от них, Закулина — чисто русская фамилия, образованная по продуктивной модели, и её носители, вероятнее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды северных губерний.