Фамилия Залисковый — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет очевидного корня, как в профессиональных или патронимических фамилиях, но словообразовательная модель указывает на географическую или топографическую основу.

Суффикс -ск- в русских фамилиях чаще всего указывает на связь с местностью. Фамилии на -ский/-ской в массе своей принадлежали дворянству или духовенству, но также могли возникать у крестьян, переселившихся из другого села или получивших прозвище по названию урочища. Основа «Залиск-» скорее всего восходит к топониму — названию реки, озера, болота или лесного массива. В говорах слово «залиск» могло означать «заливной луг», «пойменное место» или «заросшее озеро». Если предок жил у такого водоёма или на влажной низине, его могли прозвать Залисковым, а затем фамилия закрепилась за потомками.

Менее вероятна, но возможна версия от прозвища, связанного с глаголом «залискать» — в некоторых диалектах это означало «заласкать», «забаловать». Тогда Залисковый — сын человека, которого в шутку называли «залисковатым», то есть излишне ласковым. Однако эта гипотеза слабее: фамилии на -ский редко образуются от глагольных прозвищ, для этого чаще использовали суффиксы -ов/-ев.

Фамилия почти не встречается в исторических документах, что говорит о её локальном бытовании, возможно, на северо-западе России или в Поволжье, где топонимы с корнем «лиск» (лиска — лужа, топь) более распространены. Однокоренных фамилий, вроде Залискин или Залисков, практически нет, что подчёркивает уникальность варианта Залисковый.