Фамилия Заноза — редкий случай, когда прозвище стало фамилией почти без изменений, без типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это не «Занозин» и не «Занозов», а чистая основа, что указывает на относительно позднее оформление фамилии, скорее всего, в среде непривилегированных сословий: крестьян, ремесленников, казаков. В центральных губерниях России такие «голые» фамилии встречаются реже, зато на Украине, в Белоруссии и на юге России — обычное дело.

Слово «заноза» в древнерусском языке имело два значения. Первое, прямое — мелкий осколок дерева, вонзившийся в тело. Второе, переносное — человек с острым языком, задиристый, придирчивый, который «как заноза сидит» — то есть донимает других колкостями и не дает покоя. Скорее всего, фамилию дали не за физическую худобу или «колючесть» характера, а за манеру речи: язвительного, въедливого собеседника прозывали Занозой. В словаре древнерусских прозвищ таких примеров немало — человека могли назвать по одному яркому слову, которое цеплялось за него на всю жизнь.

Есть и другая, менее очевидная версия: в некоторых говорах «заноза» означала не только щепку, но и занозу в пальце, которую вытаскивали иглой. Отсюда могло возникнуть прозвище мастера, который «вынимал занозы», то есть лекаря или костоправа. Но эта гипотеза слабее: прозвища по ремеслу обычно образовывались от названия профессии (Кузнец, Мельник), а не от инструмента или действия.

Фамилия Заноза фиксируется в переписях и ревизских сказках XIX века в основном на территории Слобожанщины и Черниговской губернии — там, где украинское влияние смешивалось с русским. Встречается она и у донских казаков, что неудивительно: в казачьей среде прозвища закреплялись в качестве фамилий особенно часто и охотно, без оглядки на столичную моду на суффиксы.

Однокоренных фамилий — Занозин, Занозовский — немного, и они образованы уже по стандартной модели: от той же основы, но с добавлением суффикса принадлежности. Сама же фамилия Заноза сохранила первоначальную прозвищную форму, что делает её прямой отсылкой к характеру предка: колкого, острого на язык, неуступчивого.