Фамилия Запорожану — редкий случай, когда географическое прозвище сохранило не только корень, но и почти без изменений донесло до нас своё исходное звучание. Её основа — «запорожец», то есть житель Запорожья, исторической области в низовьях Днепра, знаменитой Запорожской Сечью. Суффикс «-ану» (в румынском написании -anu) выдает происхождение фамилии: это типичная молдавская или румынская модель образования фамилий от названия места жительства. В молдавском языке суффикс -ану означает «выходец оттуда-то» или «принадлежащий к тому месту». Так, Запорожану буквально означает «выходец с Запорожья», «запорожец».

Такая форма сложилась не в русской, а в молдавской среде. Молдавские переписчики и священники, фиксируя прозвище переселенца с левобережья Днепра, прибавляли к основе «Запорож» типичный для своего языка суффикс. Это говорит о том, что носители фамилии — потомки тех запорожских казаков или крестьян, которые в XVIII–XIX веках переселялись на земли Бессарабии (современная Молдова и часть Одесской области Украины). После ликвидации Запорожской Сечи в 1775 году многие казаки уходили за Дунай или оседали в Причерноморье, в том числе на территориях, входивших тогда в Молдавское княжество.

В отличие от более распространённых русских фамилий на -ов/-ев (Запорожцев, Запорожский), форма Запорожану сохранила иноязычную огласовку. Встречаются варианты написания — Запорожа́ну, с ударением на последний слог, что также характерно для молдавского произношения. Встретить такую фамилию сегодня можно прежде всего в Молдове, в Приднестровье и в южных районах Одесской области Украины — в местах, куда в XIX веке активно переселялись выходцы из Запорожья.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: корень «запорож» (от «за порогами» — имеются в виду днепровские пороги) + суффикс принадлежности -ану. Фамилия не дворянская, не купеческая — она изначально крестьянская или казачья, указывающая на место выхода рода. Никакого тайного смысла, кроме прямого указания на родину предка, в ней нет.