Фамилия Засиенко образована по той же модели, что и Иваненко, где суффикс -енко указывал на родство по отцу. Если Иваненко — это «сын Ивана», то Засиенко, скорее всего, означало «сын Засия». В основе лежит крестильное имя Засий — редкая форма канонического имени Захария (в бытовом произношении часто звучало как Захарий). В украинской и белорусской традиции имя могли усекать до Зась, а от него через суффикс -ий образовывали уменьшительное Засий. Именно такое имя и стало основой для фамилии.

Суффикс -енко, характерный для восточной Украины, закрепился в фамилиях в XVI–XVII веках и первоначально обозначал потомка: Засиенко — «тот, кто из рода Засия». Со временем значение «сын» стерлось, и фамилия стала наследственной, передаваясь уже по мужской линии независимо от личного имени отца.

Встречаются варианты написания: Засиенко, реже Засьенко, что связано с особенностями произношения в разных говорах. Фамилия распространена в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков переселенцев в Краснодарском крае и Ростовской области. В документах XIX века носители фамилии числились преимущественно казаками и крестьянами, что типично для украинского левобережья.

Спорных версий происхождения немного. Иногда основу связывают с прозвищем Зась — от глагола «засесть» (то есть «тот, кто засел, укрепился»), но это менее вероятно: прозвищная модель с суффиксом -енко встречается реже, чем патронимическая от имени. Если же исходить из имени, то фамилия Засиенко — прямой и прозрачный указатель на предка по имени Засий, что делает её историю типичной для украинской ономастики.