В основе фамилии Зайнуллин лежит мусульманское личное имя. Фамилия Зайнуллин восходит к мусульманскому мужскому имени Зайнулла, которое состоит из двух основ: «зайн» - «украшение» и «улла» - «Бог, Аллах». Согласно этому, имя Зайнулла в переводе с арабского означает «украшение Аллаха». Так, например, в Книгу памяти Республики Башкортостан внесен татарин Багаутдин Шагабутдинович Зайнуллин, родившийся в 1880 г. в деревне Такино Мечетлинского района Башкирии. В Книге памяти Республики Татарстан содержится информация о зажиточном крестьянине Галиулле Зайнуллине (р. 1863) из села Байлянгар Кукморского района Казанской области. В этом же источнике записан Хабибулла Зайнуллин (р. 1876), уроженец села Сосново Агрызского района Казанской области. Среди наиболее известных однофамильцев – языковед Марат Валиевич Зайнуллин (р. 1935), автор научных трудов, посвященных исследованию грамматического строя башкирского языка. Безусловно, фамилия Зайнуллин представляет собой замечательный памятник исламской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Зайнуллин можно лишь на основании серьезных генеалогических исследований.