Фамилия Зайнуллоев — тюркская по происхождению, но с арабским корнем в основе. Она образована от мужского имени Зайнулло, которое восходит к арабской конструкции «зайн аль-Ллах» — «украшение Аллаха» или «красота Бога». Это теофорное имя, то есть содержащее отсылку к Богу, и оно широко распространено среди мусульманских народов. В русском языке такие фамилии часто оформлялись с помощью суффикса -ев, который присоединяется к основам на мягкий согласный или -й. Здесь конечная гласная «о» в имени Зайнулло перешла в «о» основы, и суффикс -ев добавился к форме «Зайнулло» — так возникла фамилия Зайнуллоев.

Географически фамилия чаще всего встречается в Таджикистане, Узбекистане и среди таджикской диаспоры в России. Это не случайно: имя Зайнулло (или Зайнулла) особенно популярно у таджиков и узбеков. В русскоязычной среде фамилию могли записать с удвоенной «л» (Зайнуллаев) или с «о» на конце основы, как в нашем случае. Разница в написании объясняется разными диалектными произношениями исходного имени: в одних регионах конечный звук произносится как «а», в других — как «о». Зайнуллоев — вариант, закреплённый в паспортных документах носителей, которые сохраняют таджикскую огласовку.

С точки зрения словообразовательной модели, это типичная «патронимическая» фамилия: она указывает на отца по имени Зайнулло. Предки носителя фамилии, скорее всего, были людьми, не принадлежавшими к высшей знати, — такие фамилии в XIX–XX веках получали крестьяне, ремесленники и торговцы из Средней Азии при оформлении советских документов. Однако само имя Зайнулло в исламской традиции считалось почётным, поэтому его могли давать в семьях, стремившихся подчеркнуть религиозное благочестие.

Интересная деталь: фамилия Зайнуллоев — редкий пример, когда арабский корень соединился с тюркским суффиксом принадлежности, но при этом сохранил исходную гласную «о» в основе, что нехарактерно для русского языка. Обычно такие имена русифицируются с заменой «о» на «а» (как в фамилиях Зайнуллаев, Абдуллаев). Вариант Зайнуллоев — более точная передача таджикского произношения, где имя звучит именно как Зайнулло. Если искать однокоренные фамилии, то это Зайнуллин (татарский вариант с суффиксом -ин) и Зайнуллаев (узбекский вариант). Но Зайнуллоев стоит особняком — он указывает на конкретный регион и языковую среду, где имя не подстраивали под русскую фонетику.