Основой фамилии Зернин послужило мирское имя Зерно. Фамилия Зернин происходит от нецерковного имени Зерно. В старину такие имена были очень популярны на всей территории России, во всех слоях общества. Вероятно, нарекая младенца именем Зерно, родители желали ему счастья и богатство. Поскольку зерно издревле считалось символом рождения и плодородия, средоточия вегетативной силы, бессмертия, вечного обновления и здоровья. Веселовского записан Зерно Александр Захарьевич, костромской боярин, 1304 г. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Зерно, со временем получил фамилию Зернин.