Фамилия Зернюк образована по модели, характерной для украинской и белорусской ономастики: суффикс -юк указывает на принадлежность к роду или на происхождение от человека, названного основой. В данном случае основа — «зерн» (от слова «зерно»). Получается, что Зернюк — это «сын Зерна» или «потомок того, кого прозвали Зерном».

Прозвище Зерно могло закрепиться за человеком по нескольким причинам. Самая прямая — род занятий: крестьянин, выращивающий хлеб, торговец зерном или мельник. В русских говорах «зерно» имело и переносное значение — так могли назвать мелкого, невысокого человека (по аналогии с «песчинка»). В украинском языке слово «зерно» звучит как «зерно», но в диалектах встречается и форма «зерня», что могло дать прозвище «Зерня» с последующим суффиксом -юк.

Географически фамилия Зернюк тяготеет к западноукраинским землям (Волынь, Подолье, Галичина) и югу Беларуси. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, прозвище возникло в одном селе или группе соседних деревень, а потом разошлось с переселенцами.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Зернов — типично русская фамилия на -ов, указывающая на прямую связь с зерном как с товаром или промыслом. Зернюк — более патронимическая форма: она подчеркивает не столько профессию, сколько родство. То есть предок носителя фамилии был известен как «Зерно», а его дети стали Зернюками. Это типичная картина для украинской модели фамилеобразования, где суффикс -ук/-юк заменял русское -ов.

В документах фамилия могла писаться по-разному: Зернюк, Зернюк, реже Зерняк. Такая вариативность — следствие того, что в XIX веке фамилию часто записывали на слух, а местные говоры не всегда различали твердые и мягкие согласные.