Фамилия Жаглина — редкий пример, где суффикс указывает на женскую линию, но сама фамилия закрепилась в мужском роде. По правилам русской ономастики, фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я. То есть Жаглина — это форма женского рода от мужской фамилии Жаглин. Однако в современном употреблении (и в исторических документах) Жаглина встречается и как неизменяемая фамилия у женщин, и как исходная форма для мужчины: «Иван Жаглин», «Мария Жаглина».

Корень «жагл-» в русских говорах почти не встречается в литературном языке, но хорошо известен диалектологам. В северных и сибирских говорах «жаглить» означало «жечь, палить, обжигать». Отсюда «жагла» — головешка, уголёк, а также переносно — едкий, язвительный человек. В словаре Владимира Даля зафиксировано слово «жаглый» — жадный, падкий на чужое. Таким образом, прозвище Жагло или Жаглина могли дать либо человеку с острым языком («жжёт словами»), либо тому, кто работал с огнём — кузнецу, печнику, смолокуру.

Словообразовательный тип фамилии — отчество второго порядка: сначала появилось прозвище Жагло (или Жага), затем от него образовалось притяжательное прилагательное «Жаглин сын», которое со временем превратилось в фамилию. Суффикс -ин здесь указывает на принадлежность: «сын Жаглы». Аналогично образованы фамилии Жаров, Жаровцев — от того же корня, но с разными суффиксами.

Географически фамилия Жаглина тяготеет к северо-востоку России: встречается в Архангельской, Вологодской, Кировской областях, а также в Пермском крае. Это зона бытования северорусских говоров, где слово «жаглить» было в ходу. В центральных и южных регионах фамилия редка — там чаще встречаются однокоренные Жаров, Жарков.

Спорных версий происхождения немного. Иногда корень «жагл-» ошибочно связывают с тюркскими языками (например, «жаглы» — маслянистый), но это натяжка: фамилия имеет чёткую славянскую диалектную базу и суффиксальную модель, типичную для русских отчеств.