Фамилия Жаркынов образована от мужского личного имени Жаркын, что в переводе с казахского языка означает «светлый», «сияющий», «лучезарный». Это имя давали с пожеланием ребёнку ясной, благополучной судьбы, чтобы его жизнь была освещена удачей. Фамилия сложилась по типичной для русской и многих тюркских культур модели: к основе добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность к роду: «сын Жаркына». Так что буквально Жаркынов — это «потомок того, кого звали Светлым».

Корень фамилии — тюркский, но её окончание выдаёт влияние русской административной и языковой традиции. Такие фамилии массово появлялись в XIX — начале XX века, когда казахи и другие народы Центральной Азии получали документы, где имя отца переводили в фамилию по русскому образцу. Поэтому Жаркыновы — это почти наверняка казахи, реже — представители родственных тюркских народов (киргизы, каракалпаки), у которых имя Жаркын тоже встречается.

В казахском языке есть и другие формы этого имени: Жаркынбек, Жаркынбай, Жаркынжан. Фамилии Жаркынбеков, Жаркынбаев, Жаркынжанов — однокоренные, все они указывают на тот же корень со значением света и сияния. Интересно, что в русской среде фамилия Жаркынов иногда смешивается с похожей по звучанию Жарков — но у них разная этимология: Жарков происходит от русского прозвища Жарко (горячий, пылкий), а Жаркынов — от казахского имени.

Географически фамилия распространена прежде всего в Казахстане, особенно в южных и западных областях, где имя Жаркын традиционно популярно. В России встречается редко, в основном среди потомков казахских переселенцев или смешанных семей. Сословной принадлежности у Жаркыновых не прослеживается: в отличие от русских дворянских фамилий, эта не указывает на знатность или ремесло. Предки носителя фамилии были, скорее всего, скотоводами или земледельцами, а имя получили по личному качеству или пожеланию — никакого прозвища, связанного с профессией, здесь нет.