Основой фамилии Жеганина послужило мирское имя Жеганя. Мирское имя Жеганя, скорее всего, восходит к существительному «жега» со значением «брань, наказание». Так, нарекая младенца именем Жеганя, родные хотели, чтобы он вырос уживчивым, добродушным, уважаемым человеком. Не исключено, что фамилия Жеганина происходит от прозвища Жеганя, которое берет начало от глагола «жечь», то есть «палить, предавать огню». Вероятно, именование Жеганя указывает на род деятельности его обладателя. В таком случае, прозвище Жеганя отражает особенности характера его носителя. Не исключено, что именование Жеганя принадлежало резвому, подвижному, непоседливому ребенку. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Жеганя, со временем получил фамилию Жеганина.