Фамилия Жгунова — женская форма фамилии Жгунов. В её основе лежит прозвище Жгун, и у этого слова два основных значения.

Первое — «стручковый красный перец». В этом случае прозвище мог получить торговец или огородник, специализировавшийся на выращивании и продаже жгучего перца. Такие прозвища по роду занятий были распространены в русских торговых и крестьянских слободах.

Второе значение связано с глаголом «жечь». Владимир Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет его как «палить, предавать огню, заставлять гореть». Отсюда Жгуном могли назвать кочегара, истопника или человека с горячим, вспыльчивым характером — «обжигающего» окружающих своей энергией.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Жгун- добавился суффикс принадлежности -ов, указывающий на родство («сын Жгуна»). Ударение в фамилии падает на второй слог: Жгуно́ва.

С точки зрения географии, фамилия Жгунов встречается в центральных и южных регионах России, где традиционно выращивали перец и где сильны были отходнические промыслы (работа истопниками, кочегарами). Встречаются варианты написания через «о» — Жгонова, но это более редкая форма, возникшая из-за акающего произношения.

Таким образом, фамилия Жгунова — не случайное сочетание звуков, а меткая характеристика, данная предку: либо по его ремеслу, либо по свойствам характера, которые окружающие сравнивали с огнём или жгучим перцем.