Фамилия Жиганшин образована от мужского имени Жиганша — диалектного варианта тюркского имени Зиганша. В основе имени лежит персидский корень Зиган, который означает «жизнь», «мир», «вселенная» или «космос». Буквально имя Жиганша (Зиганша) переводится как «повелитель мира». Это типичная для татарской и башкирской ономастики модель, где к основе добавляется суффикс -ша, указывающий на «шаха», то есть правителя или владыку.

Словообразовательная схема проста: имя → притяжательный суффикс -ин → фамилия. То есть Жиганшин буквально означает «сын Жиганши» или «принадлежащий Жиганше». Такие фамилии на -ин характерны для тюркских народов Поволжья и Приуралья, особенно среди татар и башкир.

География фамилии подтверждает её корни. В Книге памяти Нижегородской области записан татарин Жиганшин Гафур, родившийся в 1897 году. А в Книге памяти Республики Башкортостан — башкир Жиганшин Жигангир Жиганшич, 1891 года рождения, из деревни Батталово Учалинского района. Оба случая показывают, что фамилия бытовала в среде тюркского крестьянства и была распространена на востоке европейской части России и в Зауралье.

Из известных носителей можно назвать Рената Рифатовича Жиганшина (родился в 1974 году) — дирижёра симфонического оркестра. Его профессиональная деятельность — редкий случай, когда фамилия вышла за пределы традиционной среды и стала ассоциироваться с академической музыкой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Жиганшин стоит в одном ряду с Зиганшиным, Зигангировым и Жигангировым. Все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами и огласовкой, что отражает диалектные особенности разных тюркских языков.