Фамилия Жупиева — это женская форма, а её мужской вариант — Жупиев. Она образована от прозвища или личного имени Жупий. Основа здесь короткая и неочевидная, что открывает простор для двух основных версий происхождения, и обе имеют право на существование.

Первая и самая прямая версия связывает фамилию с диалектным словом «жупа». В южнорусских и украинских говорах так называли кожух, тулуп, а также грубую, некрасивую одежду. Прозвище Жупа могли дать человеку, который постоянно носил такой кожух, либо, в переносном смысле, — неопрятному или медлительному человеку, который как бы «закутан» в тяжёлую одежду. Вторая версия выводит основу из тюркских языков, где корни «жуп» или «жуба» могли означать «пара», «ровня» или быть частью личного имени. В таком случае фамилия могла принадлежать человеку, чей предок носил прозвище со значением «двойник» или «ровный».

Суффикс -ев указывает на типичную русскую модель образования: Жупиев — сын Жупия. Это говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где преобладала великорусская патронимическая традиция, но сама основа могла прийти из смежных культур. Фамилия редкая, её география тяготеет к регионам с историческим влиянием тюркских народов или к южнорусским областям, где слово «жупа» было в ходу.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Жупов, Жупин, Жупанов) показывает, что вариант Жупиев — один из наименее распространённых. Это не массовая фамилия, а скорее локальная, что делает её носителей носителями уникального следа диалектного или этнического прошлого. Если отталкиваться от версии с «жупой», предки Жупиевых могли быть крестьянами или ремесленниками, чья внешность или привычка носить кожух дали повод для прозвища. Если же верна тюркская гипотеза, то фамилия — отголосок контактов с татарами, башкирами или другими народами, и её носители могли иметь смешанное происхождение.