Фамилия Зиль, вероятно, образована от мирского имени Зиль, которое восходит к балтийскому корню «zil-» - «голубой, синий». Возможно, что в основе фамилии Зиль лежит прозвище, образованное от того же корня. В этом случае прозвище Зиль мог получить человек с синюшным оттенком кожи. Также не исключено, что фамилия Зиль связана с прозвищем Зiль, которое в переводе с коми означает «трудолюбивый, старательный, прилежный, усердный».