Фамилия Зирюкина (мужская форма — Зирюкин) — это русская фамилия, образованная по простой и распространённой модели: к основе, которая чаще всего была прозвищем или именем, добавлялся суффикс принадлежности -ин. Суффикс -ин указывает на то, что фамилия произошла от слова или имени, оканчивающегося на -а или -я. В данном случае основа — «Зирюк» или, с учётом чередования, «Зиряк».

Самая сложная часть — корень. Слово «Зирюк» не встречается в современных словарях русского литературного языка, но имеет параллели в диалектах и других славянских языках. Наиболее вероятная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «зиркать» или «зирнуть», который в южнорусских и украинских говорах означает «смотреть», «глядеть», «подсматривать» или «сверкать глазами». Прозвище Зирюк могли дать человеку с острым, быстрым взглядом, «глазастому», а также тому, кто имел привычку всё подмечать. В некоторых говорах «зирка» — это искра или блеск, что также могло стать основой для прозвища.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с тюркскими языками. Корень «зир-» встречается в некоторых тюркских словах, означающих «земля», «почва» или «низ». Однако для фамилий, оканчивающихся на -ин, типично славянское происхождение основы, а тюркские заимствования обычно давали фамилии на -ов/-ев. Поэтому версия с диалектным русским глаголом выглядит предпочтительнее.

Фамилия Зирюкин, вероятно, возникла в среде крестьян или посадских людей, где прозвища были особенно живучи. Суффикс -ин часто указывал на принадлежность главе семьи: «чей?» — «Зирюкин сын», то есть сын Зирюка. Географически фамилия тяготеет к южным областям России и востоку Украины — это зона бытования тех самых говоров, где «зиркать» — обычное слово. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении от конкретного прозвища в одной или нескольких соседних деревнях. Вариант написания «Зирякин» — возможная фонетическая форма от того же корня, если в основе был «Зиряк».