Фамилия Золотопупкина — редкий случай, когда прозвище не скрылось за суффиксом, а осталось на поверхности. Если отбросить типичный женский суффикс -а, перед нами Золотопупкин — фамилия, которая образована от прозвища Золотой Пупок или Золотопупок. В русской ономастике такие «составные» фамилии, где первая часть — прилагательное (золотой), а вторая — существительное (пупок), обычно указывают на яркую, возможно, ироничную характеристику человека.

Самая вероятная версия происхождения — насмешливое прозвище. «Золотым пупком» в крестьянской среде могли назвать изнеженного, барского человека, который не привык к труду, или, наоборот, того, кто слишком много о себе возомнил. Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с ремеслом: пупком в некоторых говорах называли узел, завязку или небольшой кожаный мешочек. Тогда «золотой пупок» — это кошель для золотых монет, а прозвище мог получить казначей, меняла или просто удачливый торговец. Третья гипотеза — топонимическая: человек из деревни Золотопупки или Золотые Пупки, но таких названий в современных справочниках не зафиксировано, что делает эту версию гипотетической.

Фамилия образована по продуктивной модели «прозвище + -ин»: суффикс -ин указывает на принадлежность — «сын Золотопупка». В русских фамилиях на -ин обычно стоят основы, оканчивающиеся на -а/-я, что здесь и соблюдено (пупок → пупка). Фамилия явно недворянская: в среде знати такие «говорящие» прозвища не приживались, их обладатели — скорее всего, крестьяне или посадские люди из центральных или южных губерний России, где любили цепкие и образные уличные клички.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В открытых базах данных Золотопупкины фиксируются единично, преимущественно в Поволжье и на Урале. Современные носители часто меняли окончание на Золотопупков или вовсе сокращали фамилию, чтобы избежать неловкого звучания. Но исходная форма сохранилась — и сегодня она звучит как живой отпечаток той эпохи, когда прозвище могло закрепиться за родом на века.