Фамилия Зубков — одна из тех, где значение лежит на поверхности, но за простотой кроется несколько версий. В основе, скорее всего, лежит прозвище Зуб или уменьшительное Зубок. Первое, что приходит в голову: так могли прозвать человека с отличными зубами — большими, крепкими, с широкой улыбкой. Однако в народной традиции прозвище Зуб имело и другой смысл. Зубы в старину связывали с агрессией, цепкостью, упрямством, поэтому Зубом могли называть человека за неуживчивый характер — того, кто «показывал зубы» и умел за себя постоять.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединялся к основе прозвища, означая «сын Зубка» или «потомок Зуба». Степан Борисович Веселовский в своем ономастическом труде приводит ранние примеры: Михил Иванович Зуб Константинов (вторая половина XV века) и крестьянин Зубака Федор Микулин (1564 год, Олонец). Эти записи показывают, что прозвище бытовало в разных формах — и как Зуб, и как Зубака, что подтверждает его распространенность в допетровской Руси.

Менее очевидная версия связывает фамилию с народными представлениями о зубе как обереге или символе силы. В некоторых говорах «зубок» могло быть ласковым именем для ребенка, которого хотели видеть крепким и здоровым. Но это скорее дополнительный оттенок, а не главный источник фамилии.

Форма Зубков (с суффиксом -к-) могла возникнуть как уменьшительная от Зуб: Зубок — Зубков. В русской антропонимии такие «уменьшительные» фамилии нередко обозначали младшего или более молодого носителя прозвища. Таким образом, потомок человека по прозвищу Зубок со временем получил фамилию Зубков. Географически фамилия встречается повсеместно, но исторические записи тяготеют к северо-западу России — Олонецкий край, новгородские земли, что может указывать на очаг ее возникновения.