Фамилия Зыкины образована от личного прозаического прозвища Зык или Зыка. Так в древнерусской среде называли крикуна — обладателя зычного, то есть громкого, голоса. Слово «зык» и сейчас живёт в русском языке в значении «громкий звук, крик», а прилагательное «зычный» означает «звонкий, громогласный». Следовательно, первый носитель фамилии получил её по характерной особенности — голосу, который было слышно далеко окрест.

По словообразовательной модели фамилия относится к самому массовому типу русских фамилий на -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Зыкин — это «сын Зыка» или «человек из рода Зыка». В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от имён и прозвищ на твёрдый согласный, формант -ин характерен для основ на -а/-я, что и подтверждает прозвищное происхождение.

Отдельного внимания заслуживает дворянская ветвь Зыкиных. Старейший из известных родов восходит к XV столетию. В последующие века среди Зыкиных встречались думные дворяне, воеводы и окольничие — то есть люди, входившие в ближний круг московских государей и занимавшие высшие административные и военные должности. Это делает фамилию не просто бытовым прозвищем, а маркером принадлежности к служилому сословию, имевшему земельные владения и вотчины.

Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно — процесс закрепления прозвищ в качестве наследственных фамилий шёл несколько столетий и в разных регионах с разной скоростью. Однако ясно, что Зыкины — не поздняя искусственная фамилия, а естественное образование, возникшее в живой народной речи и лишь затем зафиксированное в документах. Фамилия сохранила память о живом слове, которое почти исчезло из повседневного обихода, но продолжает звучать в фамильном имени.