Фамилия Адайкина — женская форма фамилии Адайкин. В её основе лежит прозвище Адайка, которое носило конкретного человека. Как именно его понимать — вопрос, на который у исследователей есть как минимум два ответа.

Первый и самый вероятный связан с диалектной лексикой. В «Толковом словаре живого великорусского языка» В. И. Даля зафиксировано слово «адай» — форма повелительного наклонения от глагола «есть» (кушать). Такое словоупотребление встречалось в вологодских говорах. Прозвище Адайка, образованное от него с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -к-, могли дать человеку, который любил плотно поесть или отличался особым аппетитом. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Адайкин — «сын Адайки» или «из семьи Адайки».

Вторая версия ведёт к тюркским корням. Адай — название одного из крупнейших родов в составе казахской родоплеменной группы Малый Жуз, сложившейся в Западном Казахстане в XVI веке. Исследователь А. Нурмагамбетов связывал происхождение адайцев с кочевниками из степей Монголии или окрестностей Алтая, которые со временем смешались с другими тюркскими племенами — алтайцами, якутами. В этом случае основоположник рода Адайкиных мог быть выходцем из этого племени, а прозвище Адайка закрепилось за ним как указание на этническую или родовую принадлежность. Эта гипотеза менее вероятна, поскольку фамилия с русским суффиксом -ин и уменьшительным формантом -ка указывает скорее на бытовое прозвище, чем на прямое заимствование этнонима.

Представители рода Адайкиных упоминаются в региональных Книгах памяти. В Памятной книге Томской области записан Александр Васильевич Адайкин (р. 1935), а в Памятной книге Республики Мордовия — Александр Николаевич Адайкин (р. 1902) и Архип Игнатьевич Адайкин (р. 1906). Эти записи показывают, что фамилия бытовала как в Сибири, так и в центральной России, что косвенно подтверждает её русское происхождение от прозвища, а не прямое заимствование из тюркской среды.