Фамилия Арайкина — женская форма, образованная от фамилии Арайкин. Чтобы добраться до корня, отбрасываем суффикс -ин, типичный для русских фамилий и указывающий на принадлежность («чей?» — сын Арайки). В основе лежит имя или прозвище Арайка.

Самая вероятная версия ведёт к крестильному имени Ираклий (в переводе с греческого «герой»). В народной речи оно упрощалось до Араклий, а затем и до краткой формы Арай. Уменьшительное Арайка и дало фамилию. Однако не менее убедительно выглядит и чисто прозвищное происхождение. В русских говорах словом «арай» называли крикливого, горластого человека или, напротив, непоседу. Прозвище могло закрепиться за беспокойным ребёнком или слишком шумным работником.

Существует и тюркская версия: в татарском и башкирском языках «арай» означает «пчелиный рой» или «улей». Если предки занимались бортничеством или держали пасеку, прозвище Арай могло отражать род занятий. Но для фамилии с русским суффиксом -ин эта версия менее типична: в русской среде тюркская основа встречается реже, а прозвища по профессии обычно давали соседи, а не сам себе человек.

С точки зрения словообразования фамилия стоит в одном ряду с такими, как Бурнайкин, Кукайкин: все они образованы от прозвищ на -ай, которые в старину давали за особенности характера или внешности. Географически фамилия Арайкина встречается в Поволжье и центральных областях России, где исторически смешивались славянские и тюркские диалекты. В документах XVII–XVIII веков встречается фамилия Араев (от того же корня), но форма с суффиксом -кин — более редкая и поздняя, что указывает на происхождение именно от прозвища, а не от полного крестильного имени. Таким образом, предок носительницы фамилии, скорее всего, был либо человеком с громким голосом, либо, если верна тюркская версия, пчеловодом.