Фамилия Афенин — редкая и неочевидная. На первый взгляд кажется, что в её основе лежит имя Афанасий (через форму Афеня), но при ближайшем разборе выясняется, что это лишь одна из версий, причём не самая прямая.

Начнём с морфологии. Суффикс -ин чётко указывает на патроним — фамилию по отцу. В русских фамилиях этот суффикс присоединяли к основам на -а или -я. Значит, предка звали Афеня. Осталось понять, откуда взялось такое имя или прозвище.

Самая правдоподобная версия — от полного канонического имени Афиноген. В просторечии его сокращали до Афеня (точно так же, как Евгения — до Женя). В этом случае Афенин означает «сын Афени». Менее вероятна связь с именем Афанасий: от него обычно образовывали формы Афоня, Фоня, а не Афеня. Однако в некоторых говорах замена «о» на «е» могла дать и такой вариант, но это скорее исключение, чем правило.

Есть и другой корень — диалектный, который делает фамилию куда конкретнее. В северных и сибирских говорах «афеня» (или «офеня») — это бродячий торговец, коробейник. Офени ходили по деревням с мелким товаром: иголками, лентами, лубочными картинками. Если прозвище Афеня закрепилось за человеком именно по роду занятий, то фамилия Афенин рассказывает о предке-разносчике. Эта версия подкрепляется тем, что слово «офеня» имело собственный тайный язык (феня), а фамилия с корнем «афен-» встречается именно в тех регионах, где офенство было развито — во Владимирской, Костромской, Ярославской губерниях.

Таким образом, у фамилии Афенин два равновероятных источника: церковное имя Афиноген (через обиходную форму) или прозвище по профессии. Второй вариант связывает носителя не с абстрактным святым, а с вполне живым образом странствующего торговца, который в XIX веке был заметной фигурой в русской деревне.