Фамилия Афентов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Афентов послужило церковное имя Афиноген. Скорее всего, фамилия Афентов восходит к крестильному имени Афиноген (в переводе с греческого – «потомок богини Афины»). Основой для фамилии послужила его редкая просторечная форма Афент. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Афент, со временем получил фамилию Афентов. О точном месте и времени возникновения фамилии Афентов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Афентов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.