Фамилия Афончева — женская форма, мужская — Афончев. В её основе лежит не церковное имя Афанасий, а его обиходная, просторечная форма. В русских говорах, особенно в южных и рязанских, звук «ф» часто заменялся на «хв» или «х», а «т» перед мягкими гласными могло переходить в «ч». Так имя Афоня превращалось в Ахоня, а отчество Афончев — в Ахончев. Но в фамилии Афончев мы видим обратный процесс: основа Афон- (от Афанасий) получила суффиксальное наращение -ч-, которое свойственно уменьшительным формам (как Ваня — Ванечка, Афоня — Афонечка). Со временем форма Афонечка могла сократиться до Афонча, а от неё и образовалась фамилия Афончев. То есть предка могли звать не просто Афоня, а Афонча — ласково-уменьшительно.

Суффикс -ев- в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Афончев. Это отчество второго порядка, то есть «сын Афончи». Именно появление «ч» в корне — ключевая словообразовательная особенность, которая отличает эту фамилию от более простых вариантов вроде Афонин или Афанасьев. Это не опечатка и не вариант написания, а след живой разговорной традиции.

Носитель фамилии Афончев — потомок человека, которого в быту звали Афончей. Такое имя было широко распространено в крестьянской среде, особенно в XVI–XVII веках. Фамилия фиксируется в основном в центральных и южнорусских областях: в Тульской, Рязанской, Воронежской губерниях. Встречается и украинский вариант Афонченко, но русская модель с суффиксом -ев- выдает именно великорусское происхождение. Никакого отношения к греческому значению имени Афанасий — «бессмертный» — фамилия уже не имеет. Она чисто бытовая, «домашняя», как сотни других русских фамилий, образованных от просторечных форм крестильных имён.