Фамилия Афоничкина — яркий пример того, как в русской ономастике закрепилось уменьшительно-ласкательное имя. В её основе лежит народная форма мужского имени Афанасий — Афоничка. Само имя Афанасий пришло из греческого языка и означает «бессмертие». Модель образования фамилии проста: к основе Афоничка добавился суффикс -ин, который в русском языке указывает на принадлежность: «чей?» — Афоничкин, то есть сын, потомок Афонички. Женский вариант Афоничкина — это форма, закрепившаяся за женщинами в роду.

Интересно, что суффикс -ичк- в основе — не просто уменьшительный, а характерный для народной, разговорной среды. Такие формы (Афоничка, Воничка, Степаничка) бытовали в крестьянском и посадском быту, в то время как в дворянской среде чаще использовали полные имена или производные на -ович/-евич. Поэтому можно с уверенностью сказать: основатель рода Афоничкиных был человеком из простого сословия. В документах XVII–XVIII веков подобные «полуимена» встречаются у крестьян, ремесленников и служилых людей низших чинов.

Фамилия не слишком распространена, но встречается в центральных областях России, особенно в бывшей Тульской, Рязанской и Калужской губерниях. Там имя Афанасий было очень популярно, и его производные дали жизнь целому гнезду родственных фамилий: Афонин, Афонькин, Афоняев, Фонин. Афоничкина стоит в этом ряду особняком — из-за двойного уменьшительного суффикса она звучит особенно тепло и по-домашнему, что выдаёт её корни в народной речи.