Фамилия Афонский — один из редких случаев, когда угадывание корня упирается сразу в две разные версии, и обе имеют право на жизнь. Первая, самая прямая, отсылает к названию Святой горы Афон — земного удела Богородицы, главного центра православного монашества. Превращение Афона в исключительно монашеское обиталище закрепил Трулльский Собор, после чего скитальцы, спасавшиеся от нашествия магометан, особенно из Константинополя, устремились на полуостров. Расцвет обители пришелся на время Василия Македонянина (с 867 года), который подтвердил исключительное право монахов на жизнь там. Позже, после захвата Салоник турками в 1430 году и падения Константинополя, Афон долго сохранял привилегии, пока в 1556 году султан Селим II не отобрал у монастырей все имения. В XVII–XVIII веках Афон стал греческим центром учености и книгоиздательства: при Ватопеде основали Афонскую академию (Афониаду), при Лавре открыли типографию. После восстания 1821 года последовала турецкая оккупация, монахи рассеялись, и лишь Адрианопольский мир 1829 года вернул имения.

Вторая версия более прозаична: фамилия могла образоваться от просторечной формы крестильного имени Афанасий (с греческого — «бессмертие») — Афон. Суффикс -ский здесь ключевой: в русских фамилиях он указывает на украино-польское происхождение или на принадлежность к местности (как в фамилиях от названий городов и сел). То есть Афонский мог означать «выходец с Афона» или «сын Афона» (от имени Афанасий). Спор между этими версиями разрешается просто: географический корень выглядит правдоподобнее, потому что суффикс -ский типичен именно для топонимических фамилий, а не для производных от крестильных имен (от Афанасия ждали бы Афанасьев или Афонин). Вероятно, предок носителя фамилии либо был связан с Афонским монастырем, либо получил прозвище по месту — например, после паломничества.

В Книге памяти Смоленской области есть конкретная запись: священник Афонский Василий Иванович, родившийся в 1872 году в деревне Елисеенок Дорогобужского района. Эта запись — редкое документальное подтверждение, что фамилия бытовала в среде духовенства, что тоже намекает на связь с Афоном: многие священники и монахи получали фамилии по святым местам. Точно определить время и место возникновения рода можно лишь на основании серьёзных генеалогических изысканий, но уже сейчас ясно: Афонские — не случайная фамилия, а знак либо глубокой веры, либо географических корней, уходящих в историю православного монашества.