Фамилия Агарон — редкий для русской традиции случай, когда исходное имя почти не изменилось при переходе в фамилию. В основе лежит библейское имя Аарон (древнееврейское Aharon). В русском языке оно закрепилось в форме Агарон (с заменой начального «а» на «а» и упрощением двойной «а»). Такое написание характерно для южнорусских и украинских говоров, где «аканье» и замена «а» на «а» в безударной позиции — норма.

Фамилия образована без суффикса, по так называемой «нулевой» модели: имя Агарон стало фамилией напрямую. Это отличает её от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ин, -ский. Такая модель встречается в двух случаях: либо фамилия очень старая и оформилась до того, как суффиксальный способ стал массовым, либо она пришла из другой культуры. Для Агарон верно второе: фамилия восходит к еврейской традиции, где фамилии часто образовывали от имени отца без дополнительных суффиксов (например, Абрам, Исаак, Агарон).

Кем могли быть предки? Скорее всего, носитель фамилии Агарон — потомок человека по имени Агарон, жившего в черте оседлости (территории современных Украины, Беларуси, Молдовы). В метрических книгах и ревизских сказках XIX века фамилия встречается в Подольской, Киевской, Волынской губерниях. Социальный состав — мещане, ремесленники, иногда купцы. В отличие от фамилий на -ович или -ский, Агарон не указывает на дворянское происхождение — это фамилия людей из среды, где имя отца становилось родовым прозвищем без дополнительных оформлений.

В ономастических справочниках фамилию Агарон обычно относят к группе «библейских фамилий без суффикса». Интересная деталь: в некоторых записях XIX века встречается вариант Агаронов — попытка «русифицировать» фамилию, добавив типичный суффикс. Но в большинстве документов сохраняется именно краткая форма Агарон, что говорит о её устойчивости и осознанном сохранении исходного звучания.