Фамилия Агаронова — это женская грамматическая форма мужской фамилии Агаронов. В русской паспортной традиции она означает «дочь или жена Агаронова» и не является самостоятельной фамилией, а лишь парой к мужскому варианту. Ударение в слове плавающее: допустимы оба варианта — на второй слог (Ага́ронова) и на третий (Агаро́нова), хотя первый типичнее для русской речи.

Основа фамилии восходит к имени Агарон — местной форме библейского Аарона (в русской традиции — Арон). Словообразовательная модель проста: к имени добавили русский патронимический суффикс -ов, получив значение «сын Агарона». Такой перенос имени в фамилию через -ов характерен для русифицированных армянских фамилий. Если бы предок остался в армяноязычной среде, фамилия, скорее всего, звучала бы как Агаронян (на -ян). Форма на -ов указывает на более раннюю или более интенсивную русификацию — носители уже в XIX веке влились в русское сословие через службу, торговлю или образование.

Вторая, менее очевидная версия — еврейские корни. В ашкеназской среде имя Аарон давало фамилии типа Аронов или Аронсон. Форма Агаронов — региональный вариант, возникший под влиянием произношения в восточноевропейских общинах, где имя могли произносить через «г». Эта гипотеза правдоподобна, но встречается реже армянской.

Географически фамилия Агаронов (и её женская форма) сосредоточена на юге России — в Краснодарском крае, Ростовской области, а также в Закавказье, где исторически жили армянские общины. Среди еврейских семей она попадается, но заметно реже.