Фамилия Аглаин — редкий случай, когда основа не просто неочевидна, а почти не встречается в русском именослове. На первый взгляд она напоминает отчество от женского имени Аглая (от др.-греч. ἀγλαός — «блистающая, прекрасная»). Но здесь кроется загвоздка: фамилии на -ин обычно образуются от основ на -а/-я (Илья → Ильин, Фома → Фомин), и Аглаин вполне мог возникнуть как «сын Аглаи». Однако в документах и переписях такая модель фиксируется крайне редко: обычно от женских имён фамилии давали, если мать была вдовой или единственной кормилицей, и это было скорее исключением, чем правилом.

Гораздо вероятнее, что перед нами нестандартная форма от мужского имени или прозвища. В русских говорах и диалектах встречалось слово «аглый» — в некоторых областях так называли прожорливого, жадного человека (от «глотать» с приставкой). Не исключено, что Аглаин — это искажённое или фонетическое «Аглаев»: в южнорусских и украинских говорах фамилии на -ин могли вытеснять -ев там, где основа оканчивалась на мягкий согласный. Если исходное прозвище было Аглый (например, за характер или манеру есть), то его потомок по паспорту мог стать Аглаиным.

Есть и третья, более экзотическая версия. Фамилия может иметь искусственное или семинарское происхождение. В духовных училищах XVIII–XIX веков ученикам нередко меняли фамилии на благозвучные греческие или латинские. Аглаин могло быть переделкой от «Аглаида» (в честь святой Аглаиды) или просто калькой с греческого — «блистательный». Такие фамилии часто давали выпускникам, чтобы отличать их от однофамильцев в миру.

Географически фамилия Аглаин встречается точечно — в основном на юге России и в Поволжье, что косвенно подтверждает диалектную версию. Носителей мало, и в дореволюционных справочниках она почти не засветилась. Это значит, что перед нами не древняя боярская или дворянская фамилия, а скорее поздняя, крестьянская или мещанская, закрепившаяся за одной-двумя ветвями рода.

Какую из версий считать основной — вопрос открытый. Но если отталкиваться от частотности словообразовательных моделей, то прозвищная версия (от «аглый») выглядит убедительнее всего: она объясняет и редкую основу, и суффикс, и региональную привязку. Имя Аглая — красивая, но маловероятная гипотеза, особенно для фамилии, которая не попала в массовые списки.