Фамилия Агошкина — женский вариант фамилии Агошкин. В её основе лежит народная, обиходная форма крестильного мужского имени Агафон. В русской традиции имя Агафон, пришедшее из греческого языка (где означало «добрый», «благой»), в повседневной речи часто сокращали и переделывали на свой лад. Так появились варианты Агашка, Аганя, а также Агошка — с заменой «а» на «о» под влиянием акающего произношения.

Фамилию образовали по простой и распространённой модели: к основе Агошк- добавили суффикс -ин, который в русском языке указывает на принадлежность. Буквально Агошкин — это «сын Агошки», а Агошкина — его жена или дочь. Такая модель в XVI–XVII веках была особенно характерна для простых сословий: крестьян, посадских людей, ремесленников. Знатные роды чаще оформляли фамилии через суффиксы -ов/-ев или -ский. Поэтому можно с большой долей уверенности сказать, что основатель рода Агошкиных не принадлежал к дворянству или духовенству, а был человеком из народа.

Интересно, что фамилия Агошкина встречается не повсеместно, а имеет отчётливую региональную привязку. По данным современных исследований русских фамилий, основная масса носителей сосредоточена в центральных и южных областях России — в Тамбовской, Рязанской, Воронежской и Липецкой областях. Это косвенно подтверждает, что фамилия сложилась в зоне акающих говоров, где безударное «о» произносится как «а»: имя Агафон в быту звучало как «Агофон», а уменьшительная форма закрепилась как Агошка.

С точки зрения словообразования, фамилия Агошкина стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Агашкин, Агафонов, Агапов. Все они восходят к одному корню, но разошлись по разным суффиксальным моделям. Агошкина — наиболее «народный» вариант, сохранивший живую разговорную форму имени без книжного налёта.